ЗАПИСЬ НА ЗАНЯТИЯ — В ТЕЛЕГРАМ-КАНАЛЕ «БИОЛОГИЯ У СУРЕНА» →

БИОСИНТЕЗ БЕЛКА
ИНТЕРАКТИВНО

ДНК —транскрипция→ иРНК —трансляция→ белок · к теории ↓
ДНКРНКинтрон

Клетка

Этапы

    ТЕОРИЯ: БИОСИНТЕЗ БЕЛКА

    от гена до готового полипептида

    01Биосинтез белка. Кратко суть

    Реализация информации, записанной в генах, осуществляется через синтез белков и называется экспрессией (проявлением) генов.

    Биосинтез белка происходит в 2 этапа:

    1. Транскрипция — синтез иРНК с транскрибируемой цепи ДНК;
    2. Трансляция — синтез белка с иРНК с помощью рибосом.
    ДНК — транскрипция — РНК — трансляция — белок
    ДНК → (транскрипция) → РНК → (трансляция) → белок

    Инструкция по синтезу белка закодирована в генах (участках молекулы ДНК). Но прежде чем начать биосинтез белка, информацию о белке нужно «достать» из ДНК и доставить к месту синтеза. Этим занимается специальная молекула — информационная (матричная) РНК.

    Информация о белке переписывается с ДНК на иРНК (транскрипция). А потом иРНК соединяется с рибосомой и начинается трансляция — синтез полипептида.

    Белок — полимер, мономером которого являются аминокислоты. Для того чтобы синтезировать белок, помимо иРНК к месту синтеза необходимо доставить аминокислоты. Этим занимаются специальные молекулы транспортной РНК (тРНК).

    Помимо тРНК и иРНК имеется также рибосомальная РНК (рРНК). Она входит в состав рибосом. Именно рРНК больше всего в клетке.

    Транскрипция в ядре, трансляция в цитоплазме
    Транскрипция — в ядре, трансляция — в цитоплазме
    Схема: ДНК, иРНК, тРНК, рибосома, полипептид
    ДНК → иРНК → рибосома (+ тРНК с аминокислотами) → полипептид
    Информация о синтезе всех видов РНК также закодирована в ДНК. Синтез любой РНК осуществляется с матрицы ДНК путём транскрипции.

    02Транскрипция

    Синтез РНК на матрице ДНК. Осуществляется по принципу комплементарности и антипараллельности ферментом РНК-полимеразой. Происходит в несколько этапов.

    РНК-полимераза на ДНК: кодирующая и матричная цепи
    РНК-полимераза движется по ДНК, синтезируя РНК

    1. Инициация

    РНК-полимераза присоединяется к месту начала синтеза матричной (транскрибируемой) цепи ДНК.

    Место, к которому присоединяется РНК-полимераза, называется ПРОМОТОР. Промотор связывает РНК-полимеразу только в одной ориентации, что определяет направление транскрипции от 5′-конца к 3′-концу. В отличие от ДНК-полимеразы, РНК-полимеразе затравка для синтеза не нужна.

    Как только РНК-полимераза покинула промотор, другая молекула РНК-полимеразы может присоединиться к промотору и инициировать синтез РНК.

    2. Элонгация

    РНК-полимераза передвигается по транскрибируемой цепи ДНК и синтезирует цепь иРНК. Нуклеотиды связываются комплементарно с матричной цепочкой ДНК водородными связями и шаг за шагом присоединяются к растущей молекуле РНК.

    ДНК-дуплекс, смысловая и кодирующая цепи, направление транскрипции
    Транскрибируется только одна цепь ДНК; направление транскрипции — слева направо
    РНК-полимераза, промотор, раскручивание ДНК
    Промотор, начало синтезируемой цепи, раскручивание ДНК
    Строение РНК-полимеразы: канал поступления и канал выхода
    РНК-полимераза: канал поступления нуклеотидов и канал выхода РНК
    Доп. инфа. Материалом для синтеза РНК служат не совсем нуклеотиды, а нуклеозидтрифосфаты. Если по-простому, то это нуклеотид, но только с тремя остатками фосфорной кислоты, а не с одним. При отщеплении от них остатков фосфорной кислоты образуются нуклеотиды, которые будут входить в состав цепи, и энергия, которая и пойдёт на синтез цепи РНК. В репликации ДНК также используются именно нуклеозидтрифосфаты.

    Нуклеозид, нуклеозидмоно-, ди- и трифосфат
    Присоединение нуклеотидов к растущей цепи РНК
    Нуклеозидтрифосфат отдаёт два фосфата и встраивается в РНК

    3. Терминация

    Окончание транскрипции. РНК-полимераза доходит до специального участка — терминатора. Готовая РНК и РНК-полимераза отсоединяются от ДНК.

    Электронная микрофотография процесса транскрипции
    Электронная микрофотография транскрипции: от сайта инициации к сайту терминации растущие РНК становятся всё длиннее

    У эукариот молекуле РНК после транскрипции ещё необходимо созреть. Пока её нельзя назвать полноценной (зрелой) иРНК, она пре-РНК (первичный транскрипт). У прокариот после транскрипции сразу идёт трансляция (процессинга нет).

    03Созревание иРНК у эукариот (процессинг)

    Превращение пре-РНК в зрелую РНК называется процессинг. Он состоит из нескольких этапов.

    Модификация 5′-конца РНК (кэпирование) и 3′-конца (полиаденилирование)

    В клетке есть ферменты, разрушающие молекулы РНК, — экзонуклеазы. Чтобы только что синтезированная РНК тотчас же не подверглась разрушению, её нужно защитить. Если этого не сделать, экзонуклеазы, как пираньи, «пообгрызают» от неё нуклеотиды.

    Для того чтобы защитить РНК от экзонуклеаз, со стороны 5′-конца на неё надевается специальная молекула — КЭП (шапочка). Со стороны 3′-конца к РНК присоединяются цепочки адениловых нуклеотидов длиной ~250 нуклеотидных остатков (поли-А-хвост).

    Вырезание интронов и сшивание экзонов (сплайсинг)

    У ДНК эукариот есть информативные участки (экзоны) и неинформативные (интроны). Во время транскрипции на РНК переписываются как экзоны, которые нам нужны (в них закодирована информация о белке), так и интроны, в которых информации о белке не закодировано.

    Именно поэтому после транскрипции клетке необходимо вырезать интроны из РНК и сшить экзоны между собой.

    Сплайсинг осуществляют СПЛАЙСОСОМЫ — специальные комплексы, состоящие из ферментов и малых ядерных РНК (мяРНК) / малые ядерные рибонуклеопротеины (мяРНП).

    Транскрипция у эукариот: кэпирование, полиаденилирование, сплайсинг
    Транскрипция у эукариот и сплайсинг
    Альтернативный сплайсинг

    Или как с одного гена синтезировать несколько белков.

    Экзоны в РНК можно сшивать в разном порядке, получая тем самым с одного гена несколько разных иРНК и синтезируя с них разные белки.

    Именно благодаря альтернативному сплайсингу генов в организме меньше, чем белков, которые с них синтезируются. Альтернативный сплайсинг активно используют лейкоциты при синтезе антител (иммуноглобулинов).

    Альтернативный сплайсинг: семейство мРНК и изоформы полипептидов

    04Трансляция и генетический код

    Синтез белка на матрице иРНК с помощью рибосом. В трансляции также принимают участие молекулы тРНК, которые доставляют аминокислоты к месту синтеза белка.

    1 аминокислота закодирована на иРНК тремя нуклеотидами. Это называется КОДОН. На молекуле тРНК имеются антикодоны (последовательность из 3 нуклеотидов, комплементарная кодону).

    Если антикодон тРНК комплементарен кодону на иРНК, то тРНК отдаёт аминокислоту, которая присоединяется к растущей полипептидной цепи. Кодоны, которыми закодированы аминокислоты, можно определить по таблице генетического кода (интерактивная таблица — во вкладке «Декодер ЕГЭ» выше).

    Вторичная структура тРНК: антикодон и акцепторный хвост
    тРНК (вторичная структура): сверху антикодон, снизу акцепторный конец, куда присоединяется аминокислота
    1 аминокислота = 1 тРНК = 1 антикодон тРНК = 1 кодон на иРНК = 1 триплет на ДНК = 3 нуклеотида
    Триплеты ДНК, кодоны иРНК, антикодоны тРНК и аминокислоты
    Триплет на ДНК → кодон на иРНК → антикодон тРНК → аминокислота
    Свойства генетического кода
    1. Триплетность. Каждая аминокислота кодируется последовательностью из трёх нуклеотидов — триплетом или кодоном.
    2. Непрерывность. Между триплетами нет никаких дополнительных нуклеотидов, информация считывается непрерывно.
    3. Неперекрываемость. Один нуклеотид не может входить одновременно в два триплета.
    4. Однозначность. Один кодон может кодировать только одну аминокислоту.
    5. Вырожденность. Одна аминокислота может кодироваться несколькими разными кодонами.
    6. Универсальность. Генетический код одинаков для всех живых организмов.
    Схема трансляции: рибосома, кодоны, антикодоны, аминокислоты
    Трансляция: 1 — малая субъединица рибосомы; 2 — кодон иРНК; 3 — антикодон; 4 — аминокислоты; 5 — формирование пептидной связи между аминокислотами в функциональном центре рибосомы

    05Трансляция: этапы

    1. Инициация

    • тРНК, несущая метионин (с антикодоном УАЦ, который комплементарен старт-кодону АУГ), связывается с малой субъединицей рибосомы;
    • Малая субъединица рибосомы с тРНК распознаёт иРНК (по КЭП, старт-кодону АУГ) и связывается с ней;
    • Антикодон тРНК присоединяется к стартовому кодону АУГ;
    • К иРНК присоединяется большая субъединица рибосомы и формируются функциональные центры рибосомы. тРНК с Мет находится в P-сайте рибосомы.
    Инициация трансляции: инициаторная тРНК, старт-кодон, инициирующий комплекс
    Инициирующий комплекс: тРНК с Мет в P-сайте на старт-кодоне

    2. Элонгация

    Функциональные центры рибосомы E, P, A
    Функциональные центры рибосомы
    Функциональные центры рибосом

    A-сайт (аминоацильный центр) — сюда заходит тРНК, связанная с аминокислотой (аминоацил-тРНК);

    P-сайт (пептидильный центр) — тут находится пептидил-тРНК (тРНК с растущей полипептидной цепью);

    E-сайт — место выхода тРНК.

    • В АМИНОАЦИЛЬНЫЙ (A-сайт) центр рибосомы приходит вторая тРНК и соединяется своим антикодоном со следующим кодоном мРНК;
    • Между аминокислотами образуется пептидная связь;
    • тРНК уходит из рибосомы — рибосома перемещается на один кодон дальше по иРНК.

    Рибосома движется по иРНК в направлении от 5′-конца к 3′-концу.

    Растущий полипептид и следующая аминокислота
    Растущий полипептид
    E-, P- и A-сайты, формирование новой пептидной связи
    Формирование новой пептидной связи

    3. Терминация

    • В АМИНОАЦИЛЬНЫЙ центр попадает стоп-кодон УАА, УАГ, УГА;
    • Для него не существует тРНК с соответствующим антикодоном;
    • Ферменты отщепляют в ПЕПТИДИЛЬНОМ центре готовый полипептид от тРНК;
    • Рибосома распадается.
    На одной иРНК трансляцию может осуществлять одновременно несколько рибосом. Такое скопление рибосом на иРНК называется полисома или полирибосома.
    Полисома: несколько рибосом на одной иРНК
    Полисома (полирибосома)

    06Про тРНК

    1. Небольшие молекулы. Составляют около 15% всех РНК клетки;
    2. Имеет 3 петли, на верхушке центральной находится антикодон — нуклеотидный триплет, соответствующий кодону определённой аминокислоты;
    3. 1 тРНК переносит 1 аминокислоту;
    4. Для каждой аминокислоты своя тРНК;
    5. Присоединение аминокислоты к тРНК осуществляет специальный фермент — аминоацил-тРНК-синтетаза.
    Аминоацил-тРНК-синтетаза присоединяет аминокислоту к тРНК; третичная структура тРНК
    Аминоацил-тРНК-синтетаза «заряжает» тРНК аминокислотой; справа — третичная структура тРНК
    Транскрипция в ядре и трансляция в цитоплазме: кодоны, антикодоны, белок
    Общая схема: транскрипция в ядре, трансляция в цитоплазме

    07Особенности биосинтеза белка у про- и эукариот

    У прокариот
    • Транскрипция сопряжена с трансляцией;
    • Процессинга нет;
    • Транскрипция и трансляция происходят в цитоплазме клетки;
    • Один вид РНК-полимеразы для синтеза всех видов РНК.
    Сопряжение транскрипции и трансляции у прокариот

    1 — ДНК; 2 — РНК-полимераза; 3 — иРНК; 4 — полипептид; 5 — рибосома

    У эукариот
    • Транскрипция происходит в ядре клетки;
    • Трансляция происходит в цитоплазме клетки;
    • Есть процессинг (созревание РНК);
    • Разные виды РНК-полимераз для разных видов РНК.
    Биосинтез белка у прокариот и у эукариот
    Биосинтез белка у прокариот (слева) и у эукариот (справа)
    Строение генов: прокариотыЭукариоты
    1. ДНК кольцевая1. ДНК линейная
    2. Гены собраны в кластеры — опероны2. Опероны практически отсутствуют
    3. Интроны отсутствуют3. Есть деление на экзоны и интроны
    4. Трансляция сопряжена с транскрипцией4. Сопряжение трансляции и транскрипции отсутствует
    Сравнение строения генов прокариот и эукариот
    Сравнение строения генов и сопряжение транскрипции и трансляции у прокариот

    08Модель лактозного оперона Ф. Жакоба и Ж. Моно

    Оперон — это комплекс генов, кодирующих ферменты, входящие в одну функциональную группу или относящиеся к этапам одного биохимического процесса у прокариот.

    Оперон включает в себя
    1. Промотор (P) — участок ДНК, который распознаёт РНК-полимераза и начинает с него транскрипцию;
    2. Оператор (O) — участок ДНК, к которому присоединяется регуляторный белок (активатор или репрессор);
    3. Структурные гены (цистроны), с которых осуществляется транскрипция и синтез структурных белков;
    4. Терминатор (T) — место, где происходит терминация транскрипции (РНК-полимераза отсоединяется от цепи ДНК).

    Гены-регуляторы в оперон не входят.

    Разбирать работу оперона будем на примере лактозного оперона кишечной палочки. На ДНК имеются структурные и регуляторные гены:

    • Структурные гены кодируют структурные белки. Со структурных генов лактозного оперона будет происходить синтез ферментов, расщепляющих лактозу (лактазы);
    • Регуляторные гены кодируют регуляторные белки (активаторы и репрессоры). Регуляторные белки регулируют работу оперона. Белки-активаторы могут связываться с оператором и активировать транскрипцию. Белки-репрессоры — наоборот: при их связывании с оператором транскрипция прекращается.
    Строение оперона: регулятор, промотор, оператор, гены Z, Y, A, терминатор
    Регулятор → репрессор; оперон: промотор, оператор, структурные гены Z, Y, A, терминатор

    Когда кишечная палочка находится в среде, где есть сахар лактоза, то ей необходимо синтезировать ферменты (лактаза) для его расщепления. С лактозного оперона активно происходит транскрипция.

    Но когда лактозы в окружающей среде нет, то синтез лактазы нецелесообразен. Зачем тратить энергию и ресурсы на синтез фермента, который не нужен? Правильно, незачем…

    Вот именно поэтому, когда в окружающей среде нет лактозы, нам нужно остановить транскрипцию с лактозного оперона и прекратить синтез ферментов, расщепляющих лактозу. Для того чтобы это сделать, необходимо с гена-регулятора синтезировать белок-репрессор.

    Белок-репрессор связывается с оператором на лактозном опероне. После того как он связался с оператором, РНК-полимераза больше не может осуществлять со структурных генов транскрипцию, так как белок-репрессор ей «мешается» и «не пускает». Из-за белка-репрессора РНК-полимераза не может покинуть область промотора и начать транскрипцию со структурных генов. Синтез лактазы не происходит. Таким образом, мы выключили транскрипцию со структурных генов.

    Белок-репрессор связывается с геном-оператором
    Ген-регулятор → иРНК → белок-репрессор → оператор
    Таким образом, оперон активируется только в присутствии лактозы. Когда лактозы нет, он выключается.

    Как включить оперон обратно? Когда в среде есть лактоза, она связывается с белком-репрессором и не даёт ему присоединиться к оператору. РНК-полимеразе никто не мешает осуществлять транскрипцию с оперона.

    09Гипотеза РНК-мира (рибозимы)

    Долгое время люди не могли ответить на вопрос, что появилось раньше — РНК или белки?

    Суть в том, что для синтеза РНК необходимы ферменты, которые имеют белковую природу. А для синтеза белков нужна матрица РНК.

    В начале 1980-х годов в лабораториях Т. Чека и С. Олтмана в США была открыта каталитическая способность РНК.

    Рибозимы — молекулы РНК, которые могут выполнять роль биологических катализаторов (ферментов).

    Учёные пришли к выводу, что молекулы РНК могли существовать абсолютно автономно и самостоятельно катализировать процессы, необходимые для их воспроизведения.

    Таким образом, делаем вывод, что первыми появились именно молекулы РНК. Жизнь начала строиться на базе РНК. Потом уже появилась ДНК как постоянное хранилище генетической информации. ДНК более стабильна, чем РНК.

    Роль РНК в современном мире (следы РНК-мира)
    1. Основной носитель энергии в клетках — АТФ — это рибонуклеотид, а не дезоксирибонуклеотид;
    2. Биосинтез белка почти целиком осуществляется с помощью различных видов РНК (информационной, транспортной, рибосомальной);
    3. Для репликации ДНК также важна РНК. ДНК-полимераза не может работать без затравки (праймера), а праймер имеет РНКовую природу;
    4. Информация из РНК может переписываться в ДНК в процессе обратной транскрипции (у ретровирусов);
    5. Многие вирусы хранят генетическую информацию в виде РНК;
    6. В процессе созревания РНК также используются разные виды РНК (малые ядерные РНК входят в состав сплайсосомы).
    У некоторых организмов сплайсинг РНК может происходить без участия белков и без участия дополнительных молекул РНК: их интроны РНК работают как рибозимы и катализируют собственное удаление.